高级分析. 2.1 多样本合并比较分析 1) 合并分群分析(包括Cell Ranger和Seurat分群) Cluster Top20 Marker基因分析(包括富集、转录因子、蛋白互作、GSEA分析) 2.2 样本间差异分析(需指定比较分组) 2.3 Dotplot 1) topN差异基因表达变化dotplot(20基因以内) 2.4 细胞亚群注释 1) 细胞类型注释(可以选择SingleR或CellAssign,如选两个费用叠加计算) 2.5 重新分群 1) 挑选关键亚群进一步分群分析 2.6 拟时间序列分析 1) 拟时序状态轨迹分析 2.7 细胞相互作用网络 1) 基于表达相关性网络图 2.8 CellPhone DB细胞通讯分析 1) 基于受体配体互作 2.9 CNV预测分析 1) 肿瘤细胞基因组拷贝数变异
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